📌‏یه لیست از ابزارهای هوش مصنوعی رایگان برای کارهای مرتبط با مقاله و ریسرچ. استفاده ازشون یه هوشمندی و مراقبتی می‌خواد. هرچی از این ابزارها می‌بینید رو با چشم‌ باز استفاده کنید.

1️⃣ سایت typeset.io‎
✔️ پاسخ به سوالات بر اساس مقالات
✔️ دستیار مطالعه مقاله
✔️ بازنویسی متن

2️⃣ سایت researchrabbit.ai‎
✔️ دسته‌بندی مقالات
✔️ پیدا کردن و اتصال مقالات مشابه

3️⃣ سایت glasp.co‎ (اکستنشن)
✔️ یادداشت‌برداری از مقالات

4️⃣ سایت semanticscholar.org‎
✔️ جست‌وجوی مقاله
✔️ پیدا کردن مقالات مشابه

5️⃣ سایت consensus.app‎
✔️ پاسخ به سوال بر اساس مقاله

6️⃣ سایت elicit.com‎
✔️ پاسخ به سوال بر اساس فایل مقاله
✔️ استخراج لیست مفاهیم برای مقاله
✔️ استخراج اطلاعات از مقالات

7️⃣ سایت scite.ai‎
✔️ رفرنس‌دهی و نوشتن مرور ادبیات

8️⃣ سایت connectedpapers.com‎
✔️ پیدا کردن مقالات مشابه

8️⃣ سایت scholarcy.com‎
✔️ خلاصه سازی مقاله

🔟 سایت paperpal.com‎
✔️ کمک در نگارش مقاله

کنسرت امستردام همایون شجریان
جای دوستان خالی

یک مقاله جدید نشان می‌دهد که آلودگی پلاستیکی به صورت چشمگیری اثرات مخرب بر روی تمام مرزهای سیاره‌ای، از جمله تغییرات اقلیمی، اسیدی شدن اقیانوس‌ها و از دست رفتن تنوع زیستی را تشدید می‌کند. پیش از مذاکرات نهایی پیمان بین‌المللی پلاستیک، محققان از تصمیم‌گیران می‌خواهند که به آلودگی پلاستیکی فقط به‌عنوان یک مشکل مدیریت پسماند نگاه نکنند.

پاتریشیا ویاروبیا-گومز، نویسنده اصلی مقاله از مرکز تاب‌آوری استکهلم، می‌گوید: "ضروری است که به کل چرخه حیات پلاستیک‌ها توجه کنیم، از استخراج سوخت فسیلی گرفته تا تولید اولیه پلیمرهای پلاستیکی." پلاستیک‌ها به آن اندازه که قبلاً تصور می‌شد ایمن و خنثی نیستند. مقاله پژوهشی جدید که توسط یک تیم بین‌المللی از محققان نوشته شده، از چارچوب مرزهای سیاره‌ای برای ساختاربندی شواهد فزاینده اثرات پلاستیک بر محیط زیست، سلامت و رفاه انسانی استفاده می‌کند. سالانه ۵۰۰ میلیون تن پلاستیک تولید می‌شود، اما تنها ۹ درصد از آن‌ها در سطح جهانی بازیافت می‌شود. پلاستیک‌ها همه جا هستند: از قله کوه اورست تا عمیق‌ترین نقطه گودال ماریانا.
تیم تحقیقاتی از طریق بررسی تحلیلی مطالعات علمی درباره تأثیرات پلاستیک‌ها در محیط طبیعی نشان می‌دهد که آلودگی پلاستیکی فرآیندهای کل سیستم زمین را تغییر می‌دهد و بر همه مشکلات مهم زیست‌محیطی جهانی، از جمله تغییرات اقلیمی، از دست رفتن تنوع زیستی، اسیدی شدن اقیانوس‌ها، و استفاده از آب شیرین و زمین تأثیر می‌گذارد.
این مقاله با عنوان "Plastics pollution exacerbates the impacts of all planetary boundaries" بر ضرورت درک پیچیدگی پلاستیک‌ها تأکید دارد. به‌عنوان موادی مبتنی بر پلیمرهای مصنوعی که با هزاران ماده شیمیایی دیگر همراه هستند، تأثیرات پلاستیک‌ها در تمام چرخه حیات این محصولات و مواد رخ می‌دهد
پاتریشیا ویاروبیا-گومز، دانشجوی دکتری در مرکز تاب‌آوری استکهلم در دانشگاه استکهلم، می‌گوید: "پلاستیک‌ها به‌عنوان محصولاتی بی‌اثر دیده می‌شوند که از محصولات محبوب ما محافظت می‌کنند یا زندگی ما را آسان‌تر می‌کنند و به‌راحتی قابل پاک‌سازی هستند هنگامی که به زباله تبدیل شوند. اما این دیدگاه بسیار دور از واقعیت است. پلاستیک‌ها از ترکیب هزاران ماده شیمیایی ساخته شده‌اند. بسیاری از این مواد، مانند مختل‌کننده‌های غدد درون‌ریز و مواد شیمیایی ماندگار، دارای سمیّت و زیان برای اکوسیستم‌ها و سلامت انسان هستند. ما باید پلاستیک‌ها را به‌عنوان ترکیبی از این مواد شیمیایی ببینیم که روزانه با آن‌ها تعامل داریم."

آلودگی های پلاستیکی تأثیرات تمام مرزهای سیاره‌ای را بدتر می‌کند.
تهیه و تدوین: ح. رسولی دانشجوی دکتری بیوتکنولوژی دانشگاه تربیت مدرس تهران

مروری کوتاه بر پیری زیستی یا Biological ageing
تهیه و تدوین: ح. رسولی دانشجوی دکتری بیوتکنولوژی دانشگاه تربیت مدرس تهران
@irbioinformatics
پیری زیستی با کاهش یکپارچگی فیزیولوژیکی مشخص می‌شود و تقریباً هر عضوی از بدن، از جمله عضلات اسکلتی را تحت تأثیر قرار می‌دهد. با افزایش سن، این عضلات با کاهش در توده و عملکرد خود مواجه می‌شوند. این کاهش، که با نام "سارکوپنی یا sarcopenia" شناخته می‌شود، از سال ۲۰۱۸ به عنوان یک بیماری عضلانی طبقه‌بندی شده است، و در این میان، قدرت عضلانی بیش از توده عضلانی به‌عنوان شاخص اصلی سارکوپنی در نظر گرفته می‌شود. در حال حاضر، حدود ۱۰ درصد از سالمندان به سارکوپنی مبتلا هستند، و پیش‌بینی می‌شود که این رقم تا سال ۲۰۴۵ در اروپا به طور قابل توجهی افزایش یابد که به طور منفی بر کیفیت زندگی تأثیر خواهد گذاشت.
@irbioinformatics
مکانیسم‌های دقیق ایجاد سارکوپنی همچنان نامشخص است، اما عواملی مانند اختلال در تنظیم ایمنی و التهاب مزمن در این فرایند نقش دارند. به‌طور سنتی، تصور می‌شد که عملکرد عضله و واکنش ایمنی مستقل از هم هستند؛ اما مطالعات اخیر نشان می‌دهند که عضله اسکلتی ممکن است بر فرآیندهای ایمنی تأثیر بگذارد. اصطلاح "پیری ایمنی" به کاهش عملکرد ایمنی مرتبط با افزایش سن اشاره دارد که با آتروفی تیموس، تجمع سلول‌های T پیریافته و نقص در واکنش‌های ایمنی ذاتی همراه است.
@irbioinformatics
منبع:
Nelke C, Dziewas R, Minnerup J, Meuth SG, Ruck T. Skeletal muscle as potential central link between sarcopenia and immune senescence. EBioMedicine. 2019 Nov;49:381-388. doi: 10.1016/j.ebiom.2019.10.034

گفتم بذار جای تاکسی پیاده برم، هم ارزون‌تره هم سالم‌تر؛ تو راه بستنی، شیرکاکائو کیک و بادو‌م‌زمینی خوردم، نه ارزون شد نه سالم!

😂

پارامتر PAE یا Predicted aligned error در نرم افزار آلفافولد2
تهیه و تدوین: ح. رسولی، دانشجوی دکتری بیوتکنولوژی دانشگاه تربیت مدرس تهران
@irbioinformatics
خطای هم‌ترازی پیش‌بینی‌شده (PAE) معیاری از میزان اطمینان AlphaFold2 در موقعیت نسبی دو رزیدیو در ساختار پیش‌بینی‌شده برای توالی اعمال شده به نرم افزار است. PAE به‌عنوان خطای موقعیتی مورد انتظار در رزیدیوی آمینواسیدی X، که بر حسب آنگستروم (Å) اندازه‌گیری می‌شود، تعریف شده است، اگر ساختارهای پیش‌بینی‌شده و واقعی بر روی رزیدیوی آمینواسیدی Y هم‌تراز شوند.
@irbioinformatics

بنابراین، پارامتر PAE عملاً معیاری از میزان اطمینان AlphaFold2 از قرارگیری مناسب دامین ها و دقت موقعیت نسبی دامین ها در ساختار پیش‌بینی‌شده است.
یک امتیاز PAE پایین بین دو رزیدیو از دو دامین مختلف به معنای خطای پیش‌بینی‌شده کم است. این به نوبه خود به این معناست که AlphaFold2 به موقعیت این رزیدیوها اطمینان دارد. برعکس، امتیاز PAE بالا به این معناست که AlphaFold2 به موقعیت نسبی آن‌ها اطمینان ندارد.
نادیده گرفتن امتیاز PAE می‌تواند به تفسیر نادرست موقعیت نسبی دامین ها منجر شود. یک نمونه از این مورد، پروتئین checkpoint protein 1 حدواسط اسیب DNA (شناسه AlphaFold: AF-Q14676-F1) است. دو دامین آن به نظر می‌رسد که در فضای سه‌بعدی به هم نزدیک هستند، اما PAE نشان می‌دهد که موقعیت این دامین ها در ساختار پروتئین اساساً تصادفی است.
نمودار PAE همیشه یک خط قطری سبز تیره دارد که از بالا-چپ به پایین-راست کشیده شده است. این خط نمایانگر رزیدیوهایی است که در مقابل خود هم‌تراز شده‌اند، جایی که اطمینان به‌طور تعریف‌شده همیشه بالا است، بنابراین اطلاعات مفیدی ارائه نمی‌دهد و می‌توان آن را نادیده گرفت. اطلاعات مربوط به صحت ساختار پروتئین، از نظر جهت‌گیری‌های نسبی، در نواحی دور از خط قطری موجود در پلات قرار دارد.

میدونستید...؟ 58% از افراد به دلیل فرهنگ کاری سمی شغل خود را ترک می‌کنند.
70% از کارمندان احساس می‌کنند که درگیر مدیریت جزئی هستند.
65% از کارکنان از فرسودگی شغلی رنج می‌برند.
@irbioinformatics