Несмотря на то, что светящиеся организмы известны очень давно, и бактериальные люциферазы (белки, вырабатывающие свет за счет биохимической реакции) исследуются как минимум с 1950-х годов, многие аспекты их функционирования до сих пор неизвестны. Все ранее описанные бактериальные люциферазы были очень похожи друг на друга и состояли из двух субъединиц: LuxA и LuxB. При этом, их выделяли лишь из бактерий, обладающих подтвержденной способностью к люминесценции.

Сотрудники Центра решили пойти другим путем, и поискать возможные люциферазы в геномах разных бактерий при помощи биоинформатики. Оказалось, что в геномах ряда организмов есть редуцированные опероны, в которых закодирована лишь одна из двух субъединиц классических люцифераз. Тем не менее, эксперимент с таким белком из бактерии Enhygromyxa salina показал, что он образует комплекс из двух одинаковых частей LuxA, и при этом действительно может испускать свет. В ходе данной работы была определена активность люциферазы с разными субстратами - альдегидами, а также получена ее структура в кристалле и растворе.

Работа опубликована 22 августа в журнале Proteins: Structure, Function, and Bioinformatics (IF = 3.2)

Сотрудниками Центра была построена модель полной структуры тканевой трансглутаминазы человека TG2 с использованием AlphaFold и других методов.

Исследование проливает свет на структурные особенности активного сайта белка, что может привести к изменению принципов разработки лекарственных соединений, направленных на TG2 в контексте целиакии, болезни Альцгеймера, остеоартрита и других заболеваний. Кроме того, в работе были предложены новые, ранее не исследованные на связывание с TG2 молекулы, обладающие высоким потенциалом в качестве ингибиторов.

Работа была опубликована 10 июля в журнале Scientific Reports (IF=3.8).

Поздравляем Сергея Иващенко и коллег!

Изучение конформационной динамики белков - важное направление структурной биологии. Так, для отслеживания переходов белков из активного состояния в неактивное, могут быть использованы флуоресцентные сольватохромные метки на основе хромофора GFP.

Ученые Центра совместно с коллегами из ИБХ, МГУ и Пущино синтезировали такие красители и показали эффективность их использования на примерах бычьего рековерина и аденозинового рецептора А2А. При сравнении с уже известными сольватохромными флуорофорами не на основе хромофора GFP, ранее применявшимися для изучения GPCR, новые метки показали не только бóльшую величину отклика на ортостерические лиганды, но и отклик на аллостерические лиганды, о чем ранее не сообщалось ни для одного флуорофора.

Работа опубликована 04.07.24 в журнале iScience (IF=5.8).

Поздравляем Анатолия Белоусова и коллег!

Подведены итоги заседания секций биофизики 66-й научной конференции МФТИ!

?Лучшие доклады:

- Бурцева Анна Дмитриевна
- Веретененко Ирина Ивановна
- Николаев Андрей Сергеевич

?Лучшие доклады по секциям:

- Безручко Иван Олегович
- Березов Родион Вячеславович
- Бубен Мария Михайловна
- Бухалович Сергей Михайлович
- Дронова Елизавета Александровна
- Кузнецова Елизавета Андреевна
- Натаров Илья Игоревич
- Свистунов Антон Марксмирович

?Выдвижение на конкурс научных работ среди студентов 4 курса:
- Безручко Иван Олегович
- Бубен Мария Михайловна
- Кузнецова Елизавета Андреевна

?Выдвижение на конкурс научных работ среди студентов 6 курса:
- Веретененко Ирина Ивановна
- Николаев Андрей Сергеевич
- Свистунов Антон Марксмирович
- Уткина Анна Александровна

Мы благодарим всех докладчиков за выступления, поздравляем победителей и желаем успехов участникам конкурса научных работ!

В следующий вторник 9 апреля в 15:00 в 202 НК состоится открытая лекция приглашённого докладчика, руководителя лаборатории биомолекулярного ЯМР СПБГУ, Скрынникова Николая Руслановича, Ph.D.Тема доклада: «Некоторые приложения методов молекулярной динамики и моделирования белков в рентгеновской кристаллографии»

Приглашаются все желающие.