Есть такое выражение — "на кончике пера". Мне кажется, недавняя работа китайских ученых, опубликованная в Nature на прошлой неделе, неплохо подходит под это определение. Исследовали они обширнейшую тему — разнообразие микроорганизмов в мировом океане. Но дело даже не в грандиозности задачи, а в том, что для ее решения авторы исследования взяли за основу публично доступные метагеномные данные! Выходит, что основа для работы, которая в дальнейшем была опубликована в Nature, была доступна для любого желающего! И нет нужды самому добывать метагеномные данные, опускаясь на глубоководье или барахтаясь в прибрежных водах — все это уже собрано и отсеквенировано, а затем размещено в публичных базах данных. Нет, разумеется, одних только сырых данных мало — надо уметь их обрабатывать, а это тоже задача, мягко говоря, нетривиальная. Да и упомянутая работа включала в себя не только биоинформатические выкладки. Но сама идея того, что основу прекрасного исследования можно запросто любому желающему найти в открытых базах данных, не может не вдохновлять.

Nature

Global marine microbial diversity and its potential in bioprospecting

Nature - Analysis of 43,191 genomes obtained from publicly available marine bacterial and archaeal metagenome data provides insights into marine bacterial evolution, CRISPR–Cas defence and...

Широко известно, что британская королева Виктория была носительницей гемофилии, как и ее дочери, через которых болезнь проникла в монаршие дома России, Испании и Германии. Но и ее собственные дети тоже пострадали, в частности, ее сын Леопольд болел гемофилией и только благодаря неимоверным стараниям врачей дожил до 30 лет. Но откуда все-таки взялась гемофилия в ганноверской династии, к которой относилась королева Виктория? Проявлялась ли она в династии раньше, до Виктории? От кого она могла унаследовать болезнетворный аллель? Родословные в монарших семьях, конечно, ведутся очень тщательно, и на их основе можно сказать, что королева Виктория, похоже, стала первой носительницей злосчастного аллеля в ганноверской династии: до нее гемофилии в династии не было. По всей видимости, злополучная мутация появилась de novo в одной из X-хромосом в клетке зародышевой линии кого-то из ее родителей, и именно эта клетка с аллелем гемофилии стала гаметой, давшей начало носительнице. Поскольку появление точечной мутации в одной конкретной клетке в одном конкретном болезнетворном сайте при гаметогенезе — событие редкое и не отражается ни на родителях, ни на братьях и сестрах, унаследовавших здоровые аллели, нет ничего удивительного, что только одна Виктория вытащила несчастливый билет. Ее братьям и сестрам в этом отношении повезло больше. Хотя, если бы не ранняя смерть ее сына, может, не таким уж и несчастливым оказался этот билет: подорвать здоровье неизлечимой болезнью потенциальным наследникам в нескольких правящих домах Европы могло бы быть весьма выгодно британской короне.

*? Программирование для биологов и врачей — не так сложно как кажется!*Хотим познакомить вас с учебным центром BioMedSchool. Там вы найдёте образовательные практико-ориентированные курсы по программированию и смежным дисциплинам для биологии и медицины.

Сейчас на платформе открыта предварительная регистрация на курсы:
⚡️Введение в технологии NGS.⚡️Анализ NGS данных. Продвинутый уровень
⚡️Машинное обучение
⚡️Английский для ученыхА также доступны вебинары, направленные на отработку отдельных навыков в биоинформатике??

Учиться можно в удобном онлайн-формате, прямо из дома или с работы?По итогам обучения студенты получают удостоверение о повышении квалификации государственного образца — отличная возможность дополнить свое резюме !

Подробнее — biomedschool.ru

biomedschool.ru

Учебный центр BioMedSchool

Обучающие курсы по биоинформатике, биологии и смежным направлениям

Давненько у меня тут не было рубрики "Как можно было до такого додуматься". Исправляюсь. Недавно в журнале eLife было опубликовано исследование, посвященное тому, как несильные удары по голове влияют на нейродегенерацию. Тема насущная и важная. Многие наблюдения показывают, что различные черепно-мозговые травмы могут приводить к развитию дегенеративных процессов в мозге, достаточно вспомнить хотя бы боксеров, которые регулярно получают мощные удары по голове. А если бить по голове несильно, можно ли запустить нейродегенерацию? Как в любом исследовании, прежде всего необходимо выбрать адекватную модель, ведь бить испытуемых добровольцев по голове, разумеется, невозможно. И вот тут начинаются странности. Авторы работы почему-то выбрали в качестве модельного организма дрозофилу (!), а для того, чтобы бить мух по голове, собрали специальную ~~мухобойку~~ установку (!!!). С помощью этой установки они наносили мухам удары по голове, и оглушенные или не перенесшие удара мухи попадали в специальный контейнер. Затем оглушенных мух отбирали для дальнейшего изучения. В итоге было показано, что таки да, несильные удары по голове тоже способствуют нейродегенерации, причем самки подвержены этому сильнее, чем самцы, и на последствия удара также влияет возраст, в котором этот удар был получен. Не могу не вспомнить давнюю поговорку: "Наш вопрос прямой и плоский: что курил Корней Чуковский?". Что же эта за установка такая, которая может наносить удар с регулируемой силой по крошечной мушиной голове? Неизбежно вспоминается Левша, который блоху подковал. Почему вообще надо было брать для такого исследования мух? Не проще ли было взять просто мышей или крыс, которых бить по голове и регулировать силу удара существенно проще? В общем, в оригинальности мышления авторам работы точно не откажешь.

Иногда случаются такие ситуации скандального свойства, где кто прав, а кто виноват, определяют журналисты, обожающие громкие заголовки. И совершенно неважно, что было на самом деле — созданные ими образы въедаются в общественную память гораздо ярче, чем робкие ростки правды. Один из таких журналистских мифов, сто раз опровергнутых, но все равно остающихся на слуху и сейчас — миф о "нулевом пациенте". А началось все так.
Как только бортпроводниками в самолетах было разрешено работать не только женщинам, но и мужчинам, в авиакомпанию Air Canada на должность стюарда устроился молодой парень из Квебека по имени Гаэтан Дюга, давно грезивший о работе в авиации. Приветливый и общительный, Гаэтан был гомосексуалом и никогда этого не скрывал. Облетев почти весь мир, любвеобильный стюард, по собственному признанию, имел около 2500 партнеров, имен которых он, естественно, в подавляющем большинстве случаев не помнил. Как раз во время путешествий Гаэтана в США все чаще в больницы попадали доселе абсолютно здоровые мужчины-гомосексуалы, страдающие от заболеваний, которыми люди со здоровой иммунной системой почти никогда не болеют, вроде пневмоцистной пневмонии или саркомы Капоши. Как сейчас нам нетрудно догадаться, речь идет о ВИЧ-инфекции, дошедшей до стадии СПИДа. Гаэтан тоже не остался в стороне и где-то подцепил ВИЧ (и наверняка заразил им кучу людей), и у него развилась саркома Капоши. В гей-квартале в Сан-Франциско даже начали ходить слухи о говорившем с французским акцентом привлекательном молодом парне, который в конце веселого вечера заявлял партнеру, что заразил его "раком голубых", от которого они оба и умрут (спойлер: Гаэтан действительно умер от саркомы Капоши в возрасте 31 года, несмотря на терапию). Так вот, возвращаясь к "нулевому пациенту". Чтобы понять, откуда вообще ВИЧ мог попасть на территорию США, эпидемиологи опросили известных им пациентов со СПИДом и выяснили, в контакт с какими людьми они вступали. И в центре этой запутанной диаграммы оказался Гаэтан. И вот тут журналистская манера изложения информации дала о себе знать. Гаэтана в этой диаграмме обозначили символом О, который быстро был переписан прессой в 0 — "нулевой пациент". Как потом уверяли ученые, составлявшие диаграмму, это О означало "Outside of California", но волну было уже не остановить. С легкой руки СМИ Гаэтан стал просто воплощением мирового зла, которое принесло в США смертоносную заразу. Гаэтан пытался возражать и даже незадолго до смерти выступил на конференции по проблемам СПИДа, но его репутации это не помогло. И лишь потом было показано, что на территории Северной Америки ВИЧ присутствовал уже в 1960-е годы, и несчастный Гаэтан вовсе не является нулевым пациентом. А ведь какое звучное словосочетание, не правда ли? Как раз для желтой прессы.

Один из самых причудливых симптомов некоторых форм шизофрении — шизофазия, которую в англоязычных источниках еще называют "словесным салатом" (word salad). Больные шизофазией становятся очень болтливы, что называется, фонтан не заткнешь, говорят монологом и совершенно не нуждаются в собеседнике, но самое главное — они произносят абсолютно бессмысленные наборы слов, хотя, и это очень важно, грамматика предложений при этом остается правильной. Порой такие пациенты бывают весьма велеречивы и говорят с большим напором. Изредка пациенты не озвучивают, а выдают такую речь в письменном виде. Самый известный пример речи больного шизофазией, уже ставший медицинским мемом, начинается со слов "Родился на улице Герцена, в гастрономе номер двадцать два...", и стенограмма этого спича даже попала в Большую медицинскую энциклопедию (полный текст есть в Википедии, а послушать можно тут). Сперва речь пациента с шизофазией звучит забавно, но вообще это явление свидетельствует о крайне выраженной патологии. Несмотря на яркость симптома, похоже, физиологические основы такой бессистемной говорливости никто особо не изучал. Может, симптом уж больно редкий, но мне кажется, что его физиологические причины могут быть интересны и с клинической стороны.

Вместе с коллегами из мира науки собрали для вас очень крутую, интересную и полезную папку каналов о науке и для учёных.

Благодаря ней вы познакомитесь с Молодёжным научным клубом «Механизм» им. Ж.И. Алфёрова, фильмом Наука женского лица, узнаете из чего состоит жизнь учёных, найдёте выпуски подкаста Учёные жены и Что-то на научном, найдёте полезную информацию про интеллектуальную собственность, разработки учёных и много чего другого не менее интересного.

Кликайте сюда и сохраняйте!

Telegram

Наука

Марина Кузякина invites you to add the folder “Наука”, which includes 11 chats.

*? Летняя школа в НИИ эпидемиологии и микробиологии им. Пастера*

? Вы — студент медико-биологической специальности?

? Хотите получить опыт в научной сфере, понять важные проблемы медицины и биологии?

? Хотите научиться их решать, усилить свои практические навыки?

Регистрируйтесь на Летнюю школу «Наука — врачам будущего»

Когда? 8-15 июля 2024 г.
Где? г. Санкт-Петербург, Научно-исследовательский Институт эпидемиологии и микробиологии им. Пастера
Для кого? Для студентов медицинских и биологических специальностей (предпочтение студентам 4-6 курсов)

⏰ Прием заявок открыт до 17 мая 2024 года (включительно)

❗️УЧАСТИЕ БЕСПЛАТНОЕ

Форматы участия:
— студенты
— слушатели

Что ждёт вас на Летней школе?

➡️ знакомство с миром науки;
➡️ выполнение индивидуальных научных проектов под руководством кураторов;
➡️ защита полученных результатов на конкурсе среди участников школы;
➡️ участие в мастер-классах, квизах, квестах, журнальном клубе;
➡️ расширение рабочих связей, нетворкинг;
➡️ отличный опыт для CV, и бонусом — личные рекомендации от ведущих учёных.

Направления:
? Вирусология
Поиск новых ингибиторов жизненного цикла вирусов, определение их механизма действия, спектра активности и перспектив дальнейшей разработки, генотипирование цикрулирующих вирусов.

? Бактериология
Изучение чувствительности условно-патогенных микроорганизмов к антимикробным препаратам диско-диффузионным методом.

? Иммунология
Определение основных иммунологических маркеров и их устойчивости с помощью проточной цитометрии, ИФА, мультиплексного цитокинового анализа.

? Лабораторная диагностика
Лабораторные исследования при диагностике различных заболеваний.

? Молекулярная биология
Создание генетических конструкций de novo.

? Биоинформатика
Анализ и интерпретация больших биологических данных.

? Эпидемиология и основы
доказательной медицины
Оценка коллективного иммунитета и проведение молекулярно-эпидемиологических исследований.

? Telegram-канал школы

? Группа в ВК

? Подробная информация и регистрация на сайте