📣 «دهمین #ژورنال_کلاب شاخه‌ی دانشجویی انجمن جهانی زیست‌شناسی محاسباتی در ایران»

⌛ موضوع:

"Single-cell and Spatial Genomics in Tumor Biology"

🧑🏻‍💻 با حضور آقای ادیب میرکی

🔹«ایشان پژوهشگر برجسته‌ی وزارت بهداشت و ناشر مقالات معتبر بیوانفورماتیک بوده و علاقه‌مند به تحقیق در زمینه‌ی Perturbation Response Prediction هستند.»

❗️جهت کسب اطلاعات بیش‌تر در مورد سابقه‌ی آموزشی و پژوهشی ایشان، می‌توانید به صفحه‌ی گوگل اسکالر و لینکدین ایشان مراجعه نمائید.

🗓 تاریخ: یکشنبه، ۲ اردیبهشت ۱۴۰۳ (۲۱ آوریل)
⏰ ساعت: ۲۰ الی ۲۲

🔗 لینک ثبت‌نام: سایت رایازی
🌐 این رویداد به صورت آنلاین برگزار می‌گردد.

🔖 دوستان علاقه‌مند جهت شرکت در ژورنال کلاب توجه داشته‌باشند که جهت ایجاد پیش‌زمینه‌ی ذهنی بهتر و بهره‌مندی و مشارکت بیش‌تر شما عزیزان، مطالعه‌ی مقاله‌ی زیر پیشنهاد می‌شود.

📌 لینک مقاله

🚀Telegram
🖼LinkedIn
🖼Instagram

درصورت وجود مشکل در ورود، لطفاً به موارد زیر توجه داشته‌باشید:

1. ابتدا چک کنید ایمیلی که وارد می‌کنید، با ایمیل‌تان در سایت رایازی هم‌خوانی داشته‌باشد و ایمیل را به‌صورت نادرست وارد نکنید.

2. اگر با Gmail ثبت‌نام کرده‌اید، گزینه‌ی ورود از طریق آن را انتخاب کنید.

3. مرورگر خود را عوض کنید.

4. رمز ورود خود را Reset و یک‌بار دیگر لاگین کنید و مجدد وارد شوید.

همراهان گرامی،
لطفاً درصورتی که مشکل ورود به پلتفرم برگزاری رویداد را دارید، ابتدا رمز ورود خود را Reset نموده و درصورت پابرجا بودن مشکل، به اکانت‌های ادمین مراجعه‌ کنید‌.

📝چکیده‌ای از مقاله‌ی مورد بررسی در نهمین #ژورنال_کلاب شاخه‌ی دانشجویی انجمن جهانی زیست‌شناسی محاسباتی در ایران:

🔹️این مقاله بر روی سویه‌ی MERS ویروس کرونا (MERS-CoV) و توانایی آن برای فرار از پاسخ ایمنی میزبان تمرکز دارد.

🔹️پروتئین MERS-CoV ORF4b مسئول مهار پاسخ ایمنی ذاتی میزبان با اتصال به گیرنده‌‌ی ورود به هسته‌ی IMPα3 است. در این مطالعه، ساختارهای کریستالی‌ای با وضوح بالا ارائه شده‌است که چگونگی تعامل ORF4b را با دو عضو متمایز از خانواده IMPα نشان می‌دهد.

🔹️نکته‌ی قابل توجه در هر دو تعامل این است که در هر دو برهم‌کنش در محل P2 فقدان یک آمینواسید حیاتی را داریم که باعث می‌شود مسیر آن از روند اتصال معمول در سلول‌ها خارج شود. آزمایش‌های بیشتر نشان می‌دهند که جهش‌ها در ناحیه‌ی سیگنال متمرکزکننده‌ی هسته‌ای(NLS)، مکانیسم اتصال را تغییر می‌دهند که این تغییر در نهایت منجر به بازگشت به روند متعارف اتصال P2 Lysine می‌شود.

🔹️این یافته‌ها اهمیت مکانیسم‌های اتصال نامتعارف را برای ورود به ناحیه‌ی هسته‌ای سلول، تعامل IMPα و مهار ایمنی ذاتی را برجسته می‌کنند. علاوه بر این، این مطالعه نشان می‌دهد که نواحی اتصال ORF4b با نواحی اتصال هسته‌ای جزء NF-kB در p50 هم‌پوشانی دارند که این موضوع توضیحی محتمل برای مکانیسم مهار ارائه می‌دهد.

🔹️نتایج نشان می‌دهد که چگونه ویروس MERS-CoV می‌تواند به‌طور موثر IMPα را هدف قرار دهد تا پاسخ ایمنی را مختل کند و بر اینکه چگونه جهش‌های کوچک در ORF4b می‌توانند مکانیسم اتصال را تغییر دهند، تأکید می‌کند.(همان‌طور که در گونه‌های دیگر ویروس‌ کرونا مانند HKU5 مشاهده شده‌است)

Telegram | LinkedIn | Instagram

🆕 همگرایی الگوریتم ها و ویرایش ژنوم:
کشف بیش از ۱۸۰ سیستم ویرایش ژنی جدید❗️*
محققان در موسسه‌ی فناوری ماساچوست (MIT)، موسسه‌ی براد (Broad Institute) و موسسه‌ی ملی سلامت آمریکا (NIH)، الگوریتم جستجوی جدیدی را توسعه داده‌اند که توانسته‌است *۱۸۸ نوع جدید از سیستم‌های CRISPR را در ژنوم باکتریایی کشف کند. این سیستم‌ها می‌توانند برای ویرایش ژن، تشخیص و کاربردهای دیگر مورد استفاده قرار گیرند.

💡الگوریتم جدید که توسط پروفسور Feng Zhang و تیم او ایجاد شده، از رویکرد داده‌های بزرگ(Big Data) برای جستجوی سریع در حجم گسترده‌ای از داده‌های ژنومی استفاده می‌کند. محققان امیدوارند از این سیستم‌های جدید برای ویرایش سلول‌های پستانداران با اثرات جانبی کم‌تر بتوانند استفاده کنند.

فنگ ژانگ از پیشگامان عرصه‌ی ویرایش ژنتیکی و اولین کسی است که سیستم کریسپر را برای سلول‌های یوکاریوتی به کار برد.

🌐 لینک خبر: MIT NEWS

Telegram | LinkedIn | Instagram

📢 «نهمین #ژورنال_کلاب شاخه‌ی دانشجویی انجمن جهانی زیست‌شناسی محاسباتی در ایران»

🔸 موضوع:

"MERS-CoV ORF4b employs an unusual binding mechanism to target IMPα and block innate immunity"

🧑🏻‍💻با حضور جناب آقای دکتر میلاد غفوری

🔹«ایشان هم‌اکنون محقق دانشگاه UNSW استرالیا هستند و پیش از این مدرک دکترای خود را در رشته‌ی زیست شناسی ساختاری از دانشگاه Charles Sturt استرالیا دریافت کردند.
ایشان علاقمند به تحقیق در زمینه‌ی بررسی ساختارهای مولکولی با استفاده از تکنیک‌های آزمایشگاهی و محاسباتی هستند.»

🔹جهت کسب اطلاعات بیش‌تر در مورد سابقه‌ی آموزشی و پژوهشی ایشان، می‌توانید به صفحه‌ی گوگل اسکالر و لینکدین ایشان مراجعه نمائید.

🗓تاریخ: شنبه، ۲۸ بهمن ۱۴۰۲ (۱۷ فوریه)
⏰ساعت: ۲۲ الی ۲۴

📎 لینک ثبت نام
🌐 این رویداد به صورت آنلاین برگزار می‌گردد.

📚 دوستان علاقه‌مند جهت شرکت در ژورنال کلاب توجه داشته‌باشند که جهت ایجاد پیش‌زمینه‌ی ذهنی بهتر و بهره‌مندی و مشارکت بیش‌تر شما عزیزان، مطالعه‌ی مقاله‌ی زیر پیشنهاد می‌شود.

👈 لینک مقاله

Telegram | LinkedIn | Instagram

📣📣📣📣
📌متاسفانه علی‌رغم برنامه‌ریزی قبلی و آماده‌‌سازی همه‌ی موارد، همان‌طور که دقایقی پیش ایمیل نهایی این رویداد نیز به دست شما عزیزان رسید، با کمال تأسف ارائه‌دهنده‌ی محترم لحظاتی پیش ما را از مشکل بزرگی که برای ایشان به‌ وجودآمده مطلع ساخته و ضمن عرض پوزش از تمامی عزیزان، ژورنال‌کلاب امشب را لغو نموده‌اند.

🖇ضمن آرزوی رفع این مسئله برای ایشان، عمیقًا از مخاطبین عزیز انجمن پوزش خواسته و به شما عزیزان اطمینان‌می‌دهيم که در اسرع‌وقت این برنامه مجدداً برگزار خواهدگردید.

📢جلسه دوم با همخوانی
“Deep Learning for the Life Sciences”

📰عنوان فصل:
“Introduction to deep learning”

با ارائه:

🔵 فصل: سرکار خانم نگار عسگری (LinkedIn)

🟣 مقاله: جناب آقای بهداد نادری فرد (LinkedIn)

و با نظارت:
🔺سرکار خانم دکتر زهرا رضوانی (LinkedIn)

‼️ لازم به یادآوریست که آخرین مهلت ثبت نام در این دوره ساعت ۲۳ امشب ۱۷ ام بهمن ماه خواهد بود و بعد از آن لینک ثبت نام‌ بسته خواهد شد.

👈 لینک ثبت نام

👈 لینک دانلود کتاب

Telegram | Linkedin | Instagram

📢 «هشتمین #ژورنال_کلاب شاخه‌ی دانشجویی انجمن جهانی زیست‌شناسی محاسباتی در ایران»

🔸 موضوع:

"scMol: Integrating Single-Cell
Transcriptomics into Phenotypic Molecular Design for Target-Free Drug Discovery"

🧑🏻‍💻با حضور جناب آقای محسن نقی‌پورفر

🔹«ایشان هم‌اکنون دانشجوی سال دوم بیوانفورماتیک دانشگاه برکلی هستند و علاقه‌مند به تحقیق در زمینه‌های Generative Deep Learning/Drug Discovery/single-cell perturbation modeling هستند. ایشان مدرک  کارشناسی خود را در رشته‌ی مهندسی کامپیوتر از دانشگاه شریف دریافت کردند.»

🔹جهت کسب اطلاعات بیش‌تر در مورد سابقه‌ی آموزشی و پژوهشی ایشان، می‌توانید به صفحه‌ی گوگل اسکالر و لینکدین ایشان مراجعه نمائید.

🗓تاریخ: دوشنبه،۲۳ بهمن ۱۴۰۲ (۱۲ فوریه)
⏰ساعت: ۲۰:۳۰ الی ۲۲:۳۰

📎 لینک ثبت نام
🌐 این رویداد به صورت آنلاین برگزار می‌گردد.

📚 دوستان علاقه‌مند جهت شرکت در ژورنال کلاب توجه داشته‌باشند که جهت ایجاد پیش‌زمینه‌ی ذهنی بهتر و بهره‌مندی و مشارکت بیش‌تر شما عزیزان، مطالعه‌ی مقاله‌ی زیر پیشنهاد می‌شود.

👈 لینک مقاله

Telegram | LinkedIn | Instagram

📌همراهان گرامی،
با توجه به استقبال بالای مخاطبین‌ و نزدیک‌شدن به ساعات پایانی ثبت‌نام، به اطلاع می‌رسانیم لینک ثبت‌نام باهم‌خوانی ساعت ۲۳ سه‌شنبه، ۱۷ بهمن‌(مصادف با پایان جلسه‌ی دوم) بسته خواهد شد.

🖇چنان‌چه قصد شرکت در این رویداد را دارید، در زمان باقی‌مانده از طریق لینک‌ این پست اقدام به ثبت‌نام نمائید.

Telegram | LinkedIn | Instagram