❄ اولیـــن ژورنـــال کــلاب زمســتانـه

✨ سی‌‌یکمین #ژورنال_کلاب شاخه دانشجویی انجمن جهانی زیست‌شناسی محاسباتی در ایران
📌موضوع:
Discovery and "off-target" mechanisms off all drugs

👨🏻‍💻 با حضور جناب آقای دکتر آرش صدری

👨🏻‍💻جناب آقای دکتر آرش صدری فارغ‌التحصیل دکترای عمومی داروسازی از دانشگاه علوم پزشکی تهران و دانشجوی PhD در دانشگاه کالیفرنیا، سان فرانسیسکو(UCSF) هستند.

🖥 جهت آشنایی بیشتر با پروژه‌های تحقیقاتی جناب آقای دکتر آرش صدری می‌توانید به اکانت لینکدین ایشان مراجعه کنید.

✔️ سفر کشف مواد دارویی ترکیبی جذاب از علم و تعقیب بی‌وقفه است. کتابخانه وسیعی از مولکول‌ها را تصور کنید که هر کدام دارای پتانسیل تبدیل شدن به یک داروی نجاتبخش را دارا هستند. فرآیند کشف این داروها اغلب با شناسایی یک هدف خاص که به‌طور معمول یک پروتئین یا آنزیم مرتبط با یک بیماری، است آغاز می‌شود.

✔ با این حال، مسیر کشف و توسعه همیشه مستقیم و سرراست نیست. با وجود تسلط و احاطه به کشف داروی مبتنی بر هدف"target" محدودیت‌هایی وجود دارد.

✔ بررسی جامع بیش از ۳۲هزار مقاله و حق ثبت اختراع نشان داده است که تنها حدود ۹.۴٪ از داروهای مولکولی کوچک با این روش کشف شده‌اند.

✔ اثرات خارج از انتظار زمانی رخ می‌دهد که یک دارو با اهداف ناخواسته تداخل داشته باشد، که می‌تواند منجربه عوارض جانبی یا گاهی اوقات، مزایای درمانی غیرمنتظره شود. این تداخلات همیشه قابل پیش‌بینی نیستند و می‌توانند روند تولید دارو را پیچیده کنند.

✔ به عنوان مثال، دارویی که برای مهار یک آنزیم خاص طراحی شده است، ممکن است بر سایر آنزیم‌ها نیز تأثیر بگذارد و منجر به طیف وسیعی از اثرات بیولوژیکی شود. جالب اینجاست که برخی از موفق‌ترین داروها از طریق غربالگری کشف شدند، که در آن ترکیبات روی سلول‌ها یا ارگانیسم‌ها آزمایش می‌شوند تا اثرات آن‌ها را مشاهده کنند، بدون اینکه اهداف خاص آن‌ها را بدانند.

🗓 زمان برگزاری: یکشنبه ۲ دی ماه
🔜 ساعت برگزاری: ۱۸ به وقت تهران
🌐 ثبت‌نام در سایت رایازی

🚀 Telegram
🖼 LinkedIn
🖼 Instagram

🎉 یلدای علم و نوآوری در زیست‌شناسی محاسباتی! 🍬

بلندترین شب سال فرصتی ویژه برای دانشجویان و پژوهشگران ایرانی حوزه‌ی زیست‌شناسی محاسباتی به همراه دارد!

💡 گروه تحقیقاتی رایازی، با همکاری انجمن RSG Iran و با هدف ارتقای توان علمی دانشجویان و تسهیل ارتباط تیم‌های پژوهشی، بستری فراهم کرده تا شما بتوانید با اساتید برجسته ایرانی در حوزه‌‌ی زیست شناسی محاسباتی، از دانشگاه‌های معتبر جهان در پروژه‌های تحقیقاتی همکاری کنید.

📜 در مرحله اول، پروپوزال‌های پژوهشی منتخب از طریق سایت رایازی در اختیار شما علاقه‌مندان قرار خواهد گرفت.

📚 با مطالعه این پروپوزال‌ها، می‌توانید تمایل خود را برای مشارکت در پروژه‌های مرتبط اعلام کنید.

✅ انتخاب افراد براساس توانایی پاسخگویی به پرسشنامه اختصاصی هر پروژه و بررسی رزومه شما توسط اساتید انجام خواهد شد.

💬 رایازی تنها به‌عنوان پلی ارتباطی عمل می‌کند و انتخاب تیم‌ها و پیشبرد پروژه‌ها بر عهده اساتید است.

⭐️ اگر به دنبال توسعه دانش و مهارت‌های خود در این حوزه هستید، این فرصت را از دست ندهید!

✨ یلدایتان پر از دانش، نوآوری و موفقیت! ✨

🚀 Rayazi Group
🚀 Bioinformatic Research Group

?یوتوب گردی این هفته درباره ابرهوش مصنوعی (SAI) است که به نوعی هوش‌مصنوعی اشاره دارد که در تقریباً هر جنبه‌ای از هوش انسانی پیشی می‌گیرد.
این ویدیو در مورد اینکه ابرهوش مصنوعی چیست، چقدر با توسعه آن فاصله داریم و مزایا و خطرات احتمالی مرتبط با آن بحث می‌کند.

✔️برخی از مزایای بالقوه ابرهوش مصنوعی شامل حل مشکلات پیچیده‌ای مانند تغییرات اقلیمی و تحقیقات پزشکی، انقلاب در مراقبت‌های بهداشتی و بهینه‌سازی منابع انرژی تجدیدپذیر است.
⚠️با این حال، خطرات مهمی نیز وجود دارد، مانند از دست دادن کنترل، سوء استفاده برای اهداف مخرب و چالش‌های اخلاقی.

?این ویدیو همچنین به مثال‌های واقعی از پیشرفت‌های هوش مصنوعی اشاره می‌کند، مانند هوش‌مصنوعی که می‌تواند کد خود را بنویسد و هوش‌مصنوعی که قادر به تحلیل پرونده‌های پزشکی است.

⭐️با تماشای این ویدیو می‌توانید اطلاعات بیشتری در مورد ابر هوش مصنوعی کسب کنید.

?مشاهده ویدئو کامل یوتوب.

?گردآورنده: سارا فریدونی

?Telegram
?LinkedIn
?Instagram

#یوتوب‌گردی

?Get to Know the Speakers of the Fifth CB Talk!?

⭐️Dr. Mahdi Eskandarian Boroujeni is a molecular geneticist and bioinformatics expert who has completed his postdoctoral research at the Department of Human Molecular Genetics and Laboratory of High Throughput Technologies (LHTT) at Adam Mickiewicz University in Poland.

✨He is now working as a researcher at the German Center for Neurodegenerative Diseases (DZNE), focusing on molecular and computational approaches to understanding the mechanisms underlying neurodegenerative diseases.
Dr. Eskandarian Boroujeni’s work involves exploring transcriptional regulation, immune responses, and gene therapy strategies for neurodegenerative conditions such as Alzheimer’s and Parkinson’s disease.

⚡️He has an interdisciplinary background that bridges molecular biology and computational biology, utilizing advanced bioinformatics techniques to analyze large datasets and investigate the molecular processes involved in these diseases.

✔️His research contributions have been widely recognized, and he continues to be Involved In significant collaborations and presentations in the field. His work has been featured in various peer-reviewed journals, emphasizing the molecular mechanisms of neurodegeneration and innovative therapeutic approaches.

?In his upcoming speech at the 5th CB Talk, titled "From Brain to Blood Vessels: Decoding the Role of Inflammatory Response," Dr. Mahdi Eskandarian Boroujeni will delve into the complex relationship between inflammation and both the nervous and vascular systems.
➕He will highlight the crucial role inflammation plays in neurodegenerative diseases like Alzheimer's and Parkinson's, where inflammatory responses lead to neuron death.

➕One of his studies has shown that viruses, including COVID-19, can trigger severe inflammatory reactions in the brain, resulting in significant neuron damage.

➕In the vascular system, chronic inflammation can damage blood vessel walls, contributing to conditions such as atherosclerosis. This damage is not limited to blood vessels but can also impact the nervous system, further accelerating the progression of neurodegenerative diseases.

➕Dr. Eskandarian emphasizes the importance of understanding these inflammatory mechanisms and the interactions between the nervous and vascular systems to develop new therapeutic strategies. Computational biology methods are particularly effective in advancing this research, potentially leading to more effective treatments for both neurological and vascular conditions.

?Registeration & Details?

?Telegram
?LinkedIn
?Instagram

#cb_talk

?با سخنرانان پنجمین CB Talk بیشتر آشنا شوید!
⭐️دکتر مهدی اسکندریان بروجنی متخصص ژنتیک مولکولی و بیوانفورماتیک است که دوره پسادکترای خود را در بخش ژنتیک مولکولی انسانی و آزمایشگاه فناوری‌های پیشرفته (LHTT) در دانشگاه آدام میتسکیویچ لهستان به پایان رسانده است.

✨او در حال حاضر به عنوان محقق در مرکز آلمانی بیماری‌های نورودژنراتیو (DZNE) مشغول به کار است و تمرکز اصلی تحقیقاتشان بر روش‌های مولکولی و محاسباتی برای درک مکانیسم‌های بیماری‌های نورودژنراتیو است.
تحقیقات دکتر اسکندریان بروجنی شامل بررسی تنظیمات رونویسی، پاسخ‌های ایمنی، و استراتژی‌های ژن‌درمانی برای بیماری‌های نورودژنراتیو مانند آلزایمر و پارکینسون است.

⚡️ایشان با داشتن یک پیش‌زمینه میان‌رشته‌ای که زیست‌شناسی مولکولی و بیوانفورماتیک را با هم ترکیب می‌کند، از تکنیک‌های پیشرفته محاسباتی برای تحلیل داده‌های بزرگ و مطالعه فرآیندهای مولکولی مرتبط با این بیماری‌ها استفاده می‌کند.

✔️دستاوردهای پژوهشی ایشان به‌طور گسترده مورد توجه قرار گرفته است و کارهای او بر مکانیسم‌های مولکولی تخریب بافت عصبی و رویکردهای درمانی نوآورانه متمرکز است.

?دکتر مهدی اسکندریان بروجنی در سخنرانی خود در پنجمین CB Talk، با موضوع "از مغز تا رگ‌های خونی: رمزگشایی از نقش پاسخ التهابی" به بررسی ارتباط پیچیده بین التهاب و سیستم‌های عصبی و عروقی خواهد پرداخت.
➕ایشان به نقش کلیدی التهاب در بیماری‌های نورودژنراتیو مانند آلزایمر و پارکینسون اشاره خواهند کرد، جایی که پاسخ‌های التهابی منجر به مرگ نورون‌ها می‌شود. یکی از تحقیقات ایشان نشان داده که ویروس‌ها، از جمله ویروس کووید-۱۹، می‌توانند واکنش‌های التهابی شدیدی در مغز ایجاد کرده و باعث مرگ نورون‌ها شوند.

➕در سیستم عروقی، التهاب مزمن می‌تواند دیواره‌های رگ‌های خونی را تخریب کرده و منجر به مشکلاتی مانند آترواسکلروز شود. این آسیب‌ها نه تنها به رگ‌ها بلکه به سیستم عصبی نیز منتقل می‌شوند، که به توسعه بیشتر بیماری‌های نورودژنراتیو منجر می‌شود.

➕درک دقیق مکانیسم‌های التهابی و تعاملات بین سیستم‌های عصبی و عروقی برای توسعه روش‌های درمانی جدید بسیار اهمیت دارد. روش‌های زیست‌شناسی محاسباتی در این زمینه بسیار موثر است و این مطالعات می‌تواند به کشف درمان‌های مؤثرتر برای بیماری‌های عصبی و عروقی کمک کند.

?ثبت‌نام و جزئیات رویداد?

?Telegram
?LinkedIn
?Instagram

#cb_talk

?با سخنرانان پنجمین CB Talk بیشتر آشنا شوید!

⭐️دکتر کاترین پیلمن یک محقق برجسته در زمینه بیوانفورماتیک و زیست‌شناسی مولکولی‌ است. او به‌عنوان مدیر گروه تنظیم ژن در مرکز زیست‌شناسی سرطان در دانشگاه استرالیای جنوبی مشغول به کار است.
?تحقیقات او به‌طور عمده بر روی تنظیم ژن‌ها در سلول‌های سرطانی متمرکز است و او از تکنیک‌های بیوانفورماتیکی و آنالیز داده‌های نسل جدید توالی‌یابی برای بررسی شبکه‌های تنظیمی ژن‌ها، RNAهای حلقوی (circRNA)، میکرو RNAها و تغییرات اسپلایسینگ جایگزین(Alternative splicing) استفاده می‌کند.

?بخشی از رزومه‌ی دکتر پیلمن:
?یکی از دستاوردهای برجسته دکتر پیلمن و همکارانش کشف پروتئین Quaking است که در تنظیم اسپلایسینگ حلقوی و اسپلایسینگ جایگزین در سرطان‌ها نقش کلیدی دارد. این کشف او در مقاله‌ای در مجله Cell منتشر شد که به‌عنوان یک یافته مهم در زمینه زیست‌شناسی RNA و نقش آن در سرطان‌ها مورد توجه قرار گرفت. تحقیقات او همچنین به تحلیل شبکه‌های تنظیمی میکروRNAها پرداخته است که نقش مهمی در مهاجرت سلول‌های سرطانی دارند.
➡️The RNA Binding Protein Quaking Regulates Formation of circRNAs

?دکتر پیلمن دکترای خود را در سال ۲۰۰۹ از دانشگاه آدلاید دریافت کرده است و پس از یک دوره تحقیقاتی پسا‌دکترا در دانشگاه ایالتی اورگان به استرالیا بازگشت تا نقش فعلی خود را بر عهده بگیرد. همکاری او با پروفسور Greg Goodall در زمینه بیوانفورماتیک و تنظیم ژن نیز بسیار تاثیرگذار بوده است.

?ثبت‌نام و جزئیات رویداد?

✔️آشنایی با مرکز زیست‌شناسی سرطان استرالیا:
➕مرکز زیست‌شناسی سرطان(Centre for Cancer Biology) یکی از موسسات برجسته تحقیقاتی پزشکی در استرالیاست که از اتحاد بین دانشگاه استرالیای جنوبی (UniSA) و SA Pathology تشکیل شده است. این مرکز به تحقیقات نوآورانه در زمینه علل اصلی سرطان پرداخته و یافته‌های خود را به راهکارهای جدید برای پیشگیری و درمان این بیماری تبدیل می‌کند. این مرکز با بیش از ۲۲ تیم تحقیقاتی در حوزه‌های مختلفی از جمله لوسمی، سرطان پستان، سرطان پروستات، سرطان پوست، سرطان مغز و سرطان روده فعالیت دارد و تحقیقات گسترده‌ای در زمینه ژنومیک سرطان و تنظیم ژن انجام می‌دهد.

➕مرکز زیست‌شناسی سرطان با استفاده از تجهیزات پیشرفته مانند نسل جدید توالی‌یابی (NGS) و همکاری با بیمارستان رویال آدلاید و سایر موسسات، تحقیقات خود را با کاربردهای بالینی پیوند می‌دهد. این مرکز همچنین با شرکت‌های داروسازی بین‌المللی همکاری می‌کند تا یافته‌های خود را سریع‌تر به درمان‌های جدید تبدیل کند.

➕این مرکز بخشی از پردیس بیومدیکال آدلاید است که در ساختمانی به ارزش ۲۴۷ میلیون دلار قرار دارد و بزرگ‌ترین تجمع محققان سرطان در جنوب استرالیا را در خود جای داده است.

?Get to Know the Speakers of the Fifth CB Talk!

⭐️Dr. Katherine A. Pillman is a distinguished researcher in bioinformatics and molecular biology. As the Head of the Gene Regulation Group at the Centre for Cancer Biology, University of South Australia, her research primarily focuses on gene regulation in cancer cells. She utilizes bioinformatics and next-generation sequencing (NGS) data analysis to investigate gene regulatory networks, circular RNAs (circRNAs), microRNAs, and alternative splicing changes in cancer.

?Key Achievements:
?One of Dr. Pillman’s notable contributions is the discovery of the Quaking protein, which plays a crucial role in regulating circular and alternative splicing in cancer. This discovery was published in the journal Cell, making a significant impact in the field of RNA biology and its role in cancer progression. Her research also delves into the microRNA regulatory networks that influence cancer cell migration.
➡️The RNA Binding Protein Quaking Regulates Formation of circRNAs

?Dr. Pillman received her PhD from the University of Adelaide in 2009 and later pursued postdoctoral research at Oregon State University. She returned to Australia to take on her current role and has been collaborating with Professor Greg Goodall, a leading figure in bioinformatics and gene regulation research.

?Registration & Details?

?Telegram
?LinkedIn
?Instagram

#cb_talk

✉️معرفی RSG استرالیا، همکار RSG ایران:

⭐️انجمن بیوانفورماتیک و زیست‌شناسی محاسباتی استرالیا(ABACBS) سازمانی پیشرو در حوزه بیوانفورماتیک و زیست‌شناسی محاسباتی است که به تقویت همکاری‌ها، توسعه دانش و مهارت‌ها، و ترویج تحقیقات در این حوزه‌های علمی کمک می‌کند.

?️این انجمن، بستری را برای پژوهشگران و متخصصان فراهم می‌کند تا از طریق برگزاری کنفرانس‌ها، کارگاه‌ها و دیگر رویدادها، به تبادل اطلاعات و تجربیات بپردازند و از آخرین پیشرفت‌های علمی مطلع شوند.

?انجمن COMBINE: شبکه ملی دانشجویان و محققان جوان در زمینه‌های بیوانفورماتیک و زیست‌شناسی محاسباتی در استرالیا است.

✔️این شبکه با فراهم کردن محیطی برای یادگیری، ارتباط و همکاری بین دانشجویان و محققان جوان، به توسعه حرفه‌ای آنها کمک می‌کند. COMBINE به عنوان زیرمجموعه‌ای از ABACBS، رویدادهای مختلفی مانند کارگاه‌ها، سمینارها و جلسات شبکه‌سازی را سازماندهی می‌کند تا فرصت‌های بیشتری برای دانشجویان جهت یادگیری و مشارکت در جامعه علمی فراهم شود.

?به زودی قرار است در یک رویداد بزرگ  با همکاری RSG استرالیا و با حضور محققان برجسته بین المللی، در خدمت شما عزیزان باشیم.?

?ثبت‌نام و جزئیات رویداد

✉️About Australian ISCB-RSG, RSG-IRAN’s collaborator

⭐️ABACBS: The Australian Bioinformatics and Computational Biology Society (ABACBS) is a leading organization in the fields of bioinformatics and computational biology, dedicated to fostering collaboration, enhancing knowledge and skills, and promoting research within these scientific domains.

?️The society provides a platform for researchers and professionals to exchange information and experiences through conferences, workshops, and other events, keeping them informed of the latest scientific advancements.

?COMBINE: This is the national network for students and early-career researchers in bioinformatics and computational biology across Australia.

✔️COMBINE helps in professional development by providing a supportive environment for learning, networking, and collaboration among young researchers. As a part of ABACBS, it organizes various events such as workshops, seminars, and networking sessions to offer students more opportunities to learn and engage with the scientific community.

?We are excited to announce that we will soon be hosting a major online event in collaboration with RSG Australia, featuring renowned international researchers. We look forward to welcoming you to this prestigious event.*?***

?Registration & Details

?Telegram
?LinkedIn
?Instagram

#cb_talk

❓آیا هوش مصنوعی می‌تواند ذهن افراد را بخواند؟

?در ویدیوی این هفته به بررسی تحقیقاتی که توسط دانشمندان دانشگاه تگزاس و دانشگاه فناوری سیدنی انجام می‌شود، می‌پردازیم.
این محققان در تلاش هستند تا با استفاده از تکنیک‌های پیشرفته هوش مصنوعی، افکار انسانی را رمزگشایی کنند. با تحلیل اسکن‌های fMRI و داده‌های EEG، آن‌ها فعالیت‌های مغز را به کلمات و عبارات خاصی نقشه‌برداری می‌کنند.

⚡️این تحقیق پتانسیل عظیمی برای افراد دارای معلولیت دارد، زیرا می‌تواند به آنها کمک کند تا به طور مؤثرتری ارتباط برقرار کنند. علاوه بر این، این فناوری می‌تواند بینش‌های ارزشمندی درباره ذهن انسان ارائه دهد و به ما کمک کند تا بفهمیم چگونه افکار و احساسات ما شکل می‌گیرند و پردازش می‌شوند.

⚠️با این حال، توانایی رمزگشایی افکار انسان نگرانی‌های اخلاقی قابل توجهی را به همراه دارد زیرا می‌تواند منجر به از دست رفتن حریم شخصی و آزادی فکر شود. همچنین نگرانی‌هایی درباره سوءاستفاده احتمالی از این فناوری، مانند استفاده برای نظارت یا دستکاری، وجود دارد.

✔️این ویدیو به بررسی مزایا و خطرات احتمالی این فناوری می‌پردازد و بینندگان را تشویق می‌کند تا به پیامدهای اجتماعی این تحقیقات فکر کنند.

?مشاهده ویدئو کامل یوتوب.

?گردآورنده: سارا فریدونی

?Telegram
?LinkedIn
?Instagram

#یوتوب‌گردی